PROTEIN ENGINEERING

Výzkumné zaměření

• Výzkumná skupina se zaměřuje na proteinové a metabolické inženýrství pro biomedicínu. Věnuje se vývoji nových teoretických konceptů, softwarových nástrojů a lab-on-chip technologií pro proteinové inženýrství. Tyto nově vyvinuté nástroje pro design proteinů s vylepšenými vlastnostmi jsou využívány k biokatalýze, biodegradaci, biosensingu či pěstování a diferenciaci buněk. Na základě své práce publikovala skupina již více než 200 původních článků a 20 knižních kapitol, získala 7 mezinárodních patentů a založila biotechnologickou spin-off firmu Enantis s.r.o.
• Bioinformatika – identifikace zajímavých genů v genomických databázích k molekulárnímu klonování a experimentální charakterizaci
• Lab-on-chip technologie – vývoj mikrofluidních lab-on-chip technologií pro výzkum v biochemii a biomedicíně
• Inženýrství degradačních drah – návrh a konstrukce bakteriálních kmenů, které exprimují nově sestavené biochemické dráhy
• Stabilizace proteinů – počítačový design stabilizačních mutací
• Mezinárodní spolupráce: ETH Zurich, Švýcarsko; Tohoku University, Katahira, Japonsko; University of Cambridge, Cambridge, Velká Británie; Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability (CFB), Copenhagen, Dánsko; Spanish National Research Council (CSIC), Madrid, Španělsko

Hlavní cíle

• Počítačový design a inženýrství hyperstabilních proteinů
• Zavádění nových teoretických konceptů pro proteinové inženýrství
• Vývoj snadno ovladatelných softwarových nástrojů a mikrofluidních čipů

Technologické vybavení

• Výpočetní klastr
• Cirkulární dichroismus
• Robot na sběr kolonií
• Hardware a software pro počítačové modelování
• Mikrofluidika
• Pipetovací robot
• Rapid quench flow systém
• Stopped flow kinetický systém