MEDICINAL CHEMISTRY

doc. Mgr. Kamil Paruch, Ph.D.

E-mail: kamil.paruch@fnusa.cz

Klíčová slova

Organická syntéza, Medicinální chemie, Chemická biologie, Kinázy, Analogy nukleosidů, Nukleázy.

Výzkumné zaměření

Výzkum v naší laboratoři se zaměřuje na vývoj syntetických metod a strategií pro přípravu strukturně netriviálních organických sloučenin pro aplikace v biomedicínském výzkumu. Naše projekty jsou zaměřeny na:
Vývoj účinných inhibitorů některých „nerutinních“ kináz (CLK, HIPK).
Syntézu nových modulátorů adenylyl cykláz na bázi forskolinů
Identifikaci inhibitorů vybraných opravných drah poškození DNA (nukleázy Mre11 a Mus81).
Přípravu nových chemických sond pro buněčnou diferenciaci a fluorescenčních sond pro biologické systémy.
Organickou syntézu organických sloučenin střední strukturní komplexity.
Medicinální chemii – optimalizaci raných “lead” sloučenin.

Hlavní cíle

Totální syntéza nových analogů forskolinu a testování jejich aktivity proti lidským adenylyl cyklázám.
Identifikace nových inhibitorů nedostatečně prozkoumaných proteinových kináz.
Vývoj SAR kolem stávajících proprietárních inhibitorů nukleáz MRE11 a Mus81; identifikace submikromolárních inhibitorů.
Syntéza a biologické profilování nových karbocyklických C-nukleosidů.

Technologické vybavení

HPLC s UV, MS a CAD detekcí
NMR spektrometr
mikrovlnný reaktor
vysokotlaký reaktor
automatické purifikační systémy

Asistentka

Mgr. Gabriela Pavlíková
E-mail: gabriela.pavlikova@fnusa.cz

Členové týmu

doc. Mgr. Kamil Paruch, Ph.D.
Mgr. Gabriela Pavlíková
Bc. Klára Kejdová
Mgr. Lukáš Maier, Ph.D.
Mgr. Jakub Švenda, Ph.D.
Pawel Szczepanik, MSc

Vybrané výsledky

Khirsariya, P.; Pospíšil, P.; Maier, L.; Boudný, M.; Babáš, M.; Kroutil, O.; Mráz, M.; Vácha, R.; Paruch, K. Synthesis and profiling of highly selective inhibitors of methyltransferase DOT1L based on carbocyclic C-nucleosides. J. Med. Chem. 2022, 65, 5701.

Tharra, P. R.; Mikhaylov, A.; Švejkar, J.; Gysin, M.; Hobbie, S. N.; Švenda, J. Short synthesis of (+)-actinobolin: Simple entry to complex small-molecule inhibitors of protein synthesis. Angew. Chem. Int. Ed. 2022, 61, e202116520.

Němec, V.; Maier, L.; Berger, B.-T.; Chaikuad, A.; Drápela, S.; Souček, K.; Knapp, S.; Paruch, K. Highly selective inhibitors of protein kinases CLK and HIPK with the furo[3,2-b]pyridine core. Eur. J. Med. Chem. 2021, 215, 113299.

Vojáčková, P.; Michalska, L.; Nečas, M.; Shcherbakov, D.; Bottger, E. C.; Šponer, J.; Šponer, J.; Švenda, J. Stereocontrolled Synthesis of (−)-Bactobolin A. J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 7306.

Boudný, M.; Zemanová, J.; Khirsariya, P.; Borský, M.; Verner, J.; Černá, J.; Oltová, A.; Šeda, V.; Mráz, M.; Jaroš, J.; Kašparková, M.; Jašková, Z.; Spunarová, M.; Brychtová, Y.; Souček, K.; Drápela, S.; Mayer, J.; Paruch, K.; Trbušek, M. Novel Chk1 inhibitor MU380 exhibits significant single-agent activity in TP53-mutated chronic lymphocytic leukemia cells. Haematologica 2019, 104, 2443.

Němec, V.; Hylsová, M.; Maier, L.; Flegel, J.; Sievers, S.; Ziegler, S.; Schröder, M. Berger, B.-T.; Chaikuad, A.; Valčíková, B.; Uldrijan, S.; Drápela, S.; Souček, K.; Waldmann, H.; Knapp, S.; Paruch, K. Furo[3,2-b]pyridine: A novel privileged scaffold for highly selective kinase inhibitors and effective modulators of the Hedgehog pathway. Angew. Chem. Int. Ed. 2019, 58, 1062.